幸存者发现岛屿更多秘密，包括时间扭曲与神秘原住民。
海洋航空815航班幸存者在神秘岛上继续求生之旅。他们发现了岛上的更多秘密：时间异常区域、地下实验设施，以及被称为“其他人”的原住民群体。杰克领导幸存者建立营地，洛克则痴迷于探索岛上的神秘力量。当他们发现一个能够预测未来的装置后，团队分裂为两派：一派想要逃离岛屿，另一派认为应该留下保护这个神奇的地方。而此时，“其他人”的领袖本杰明向幸存者们揭示了岛屿的终极秘密。
科幻设定更加宏大复杂，角色命运交织令人唏嘘。岛屿谜团层层揭开，保持悬疑感的同时解答了部分前季疑问。